Mannen fick kontakt med pojken på olika chattsidor på nätet och i maj i år åkte mannen upp från de södra delarna av Sverige till Värmland för att träffa 13-åringen.
Pojken berättade senare för en sjuksköterska vad som hänt och i augusti anhölls den 48-årige mannen.
Mannen nekade till brott och hävdade under rättegången att han kört de cirka 50 milen från hemmet till Värmland för att var orolig för pojken och ville prata med honom.
Ord står mot ord men enligt tingsrätten visar chattkonversationerna mannens egentliga avsikt med att åka till Värmland för att träffa pojken. Han döms för våldtäkt mot barn, sexuellt ofredande och barnpornografibrott till två års fängelse.
Tidigare har två andra män åtalats för våldtäkt mot samma pojke. De dömdes dock inte till våldtäkt utan sexuellt övergrepp mot barn då tingsrätten inte fann det bevisat att pojken våldtagits.